身近な生命科学実習
Molecular Biology
身近な生命科学実習
ADVES Boot Camp
－マグロ属魚類の魚種類判別－
– Molecular Biology in our daily lives –
Classification of tuna species using Molecular Biology Approach
マグロの魚種を判別する実験体験を、6日間の集中講義として開講しています。この実習は、学部1－2年生を対象に、文理の垣根を越えて少人数制で実施しています。マグロのPCR実験を通じて、DNA、PCR、次世代シーケンス等の身近な生命科学用語を理解し、基礎的な実験スキルや考察方法を取得できるようなカリキュラムを実施します。 また、講義時間内で外部講師による特別セミナーを設け、“考えるトレーニング” についても取り組んでいます。
We offer a short-term course (6 days in 2 weeks) for 1st and 2nd year undergraduate students, which provides practical experience in identifying tuna fish species. The curriculum is designed to help both humanities and science major students to understand life science terms such as DNA, PCR, and various sequencing technologies through molecular biological analysis. Moreover, students will acquire the necessary experimental skills and discussion methods for analyzing data, where "scientific thinking" would be trained. Also, guest lecturers are invited to special seminars that are held during lecture hours.
魚の専門家でない限り、マグロ（寿司、切り身、ブロックなど）を味や形から区別して分類することは非常に困難です。では、マグロの種類を正確かつ再現性よく判断するにはどうすればよいでしょうか？
It is complicated to classify tuna (sushi, fillets, blocks) by taste or shape unless you are a fish expert. Then, how do we determine the type of tuna accurately and reproducibly?
この実習では、まず、マグロの切り身または寿司を標本として受け取ります。 次に、分子生物学的手法を使用してマグロを解析し、それがどのマグロ種であるかを判断します。 最後に、このコースでの結果についてミニプレゼンテーションを行います。
In this practical course, we will first receive a tuna fillet or sushi as a specimen. Next, we will analyze the tuna using molecular biological methods to determine which tuna species it is. Finally, we will give a mini-presentation on our results in this course.
実習の流れGeneral flow
- 実習内容の説明
- マグロからDNA抽出
- 遺伝子増幅法（PCR法）によるDNAの増幅とDNA配列特異的切断酵素による切断
- DNA断片を電気泳動により分離して検出
- 得られたDNAのパターンからマグロの種別判別
- 結果に関する発表および、ディスカッション
- ミニレクチャー
- Explanation of the contents of this training
- DNA extraction from tuna specimen
- DNA amplification by PCR and digest with restriction enzymes
- Electrophoresis of the DNA fragments and detection
- Identification of tuna species based on the DNA fragments pattern
- Presentation and discussion about results
- Mini-lecture *It is held irregularly
上記に加えて、参加している学生各自の学習到達度・実験の進行度合いに個別に対応し、初心者でも理解可能なシンプルな課題を個人／グループに随時与えています。
"Thinking training"
In addition to the above flow, individuals/groups are given simple assignments that even beginners can understand, individualized attention to the participating students' learning achievement and experimental progress. We cannot easily find the answer by searching the Web or browsing past print collections. Also, Each student/group needs to design and conduct various experiments.
Web 検索や過去のプリント集を閲覧しても、答えは簡単には見つかりません。各自／グループは、実験を自らデザインして各種の検討を行う必要もあります。学生のみなさんには、規定の実習の作業内容に追加する “考えるトレーニング”、ならびに答えが確定していない課題に挑戦する体験について、楽しみながら実習に取り組んで欲しいと思っています。
"thinking training" that will be added to the work content of the prescribed practical flow, the experience of challenging tasks for which the answers are not fixed. We hope that students will enjoy the stay in this course.
これまでに行った外部講師によるミニレクチャーMini lectures in the past
2017年｜講義・演習
2017 | Lecture + exercise
-
講師・日時
Lecturer
Date and time -
西方 公郎 先生
ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンシングサービス
プロダクトサポート 2017年8月3日（水）
13時30分～15時00分 -
Dr. Kimio Nishikata
Eurofin Genomics Co., Ltd.
Next Generation Sequencing Service
Product Support Wednesday, August 3, 2017
13:30-15:00
2018年｜講義・演習
2018 | Lecture + exercise
-
講師・日時
Lecturer
Date and time -
西方 公郎 先生
ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンシングサービス
プロダクトサポート 2018年8月1日（水）
13時30分～15時00分 -
Dr. Kimio Nishikata
Eurofin Genomics Co., Ltd.
Next Generation Sequencing Service
Product Support Wednesday, August 3, 2018
13:30-15:00
2019年｜講義
2019 | Lecture
-
講師・日時
Lecturer
Date and time -
ジョゼフィーヌ・ガリポン 先生
慶應義塾大学
先端生命科学研究所 2019年8月6日（火）
13時00分〜14時45分（3時限目） -
Dr. Josephine Garipon
Keio University
Institute for
Advanced Life Sciences Tuesday, August 6, 2019
13:30-14:45